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Informações sobre alterações típicas associadas com a infecção por vírus Zika são escassas, mas incluem, durante o curso da doença, leucopenia, trombocitopenia e ligeira elevação da desidrogenase láctica sérica, gama glutamil transferase e de marcadores de atividade inflamatória (proteína C reativa, fibrinogênio e ferritina). Não há relatos de infecção secundária, pelo fato do vírus apresentar um único sorotipo.
O diagnóstico laboratorial específico baseia-se principalmente na detecção de RNA viral a partir de espécimes clínicos. O período virêmico não foi estabelecido, mas se acredita que seja curto, o que permitiria, em tese, a detecção direta do vírus até 4-7 dias após o início dos sintomas, sendo, entretanto, ideal que o material a ser examinado seja até o 5º dia. Os ácidos nucléicos do vírus foram detectados em humanos entre 1 e 11 dias após início dos sintomas e o vírus foi isolado em primata não-humano até 9 dias após inoculação experimental.
A técnica utilizada é a reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa (RT-PCR) e sorologia para titulação de anticorpos IgM e IgG. Importante destacar que o exame RT-PCR é realizado pelos laboratórios de referência da rede SUS (ver descrição no tópico 3.1).
Algoritmo conduta em casos suspeitos e tipos de exames solicitados:

Investigação Laboratorial: instruções para coleta e encaminhamento das amostras biológicas para os laboratórios de referência
Em virtude do aumento do número de casos suspeitos de infecção pelo vírus Zika e a possível correlação com os casos de microcefalia e outras alterações congênitas, a Coordenação Geral de Laboratórios (CGLAB/SVS), elaborou seu plano de ação para o fortalecimento do sistema de laboratórios (SISLAB) com o fornecimento de insumos e equipamentos para realização de exames, capacitação de recursos humanos e incorporação de novas tecnologias para enfrentamento da epidemia de vírus Zika. A rede de laboratórios atualmente é composta por 22 Laboratórios Centrais especializados na técnica de biologia molecular para qualquer agravo, atualmente está subdividido de acordo com a expertise do diagnóstico.
Especificidades dos laboratórios centrais:

Fluxograma para investigação laboratorial de amostras biológicas suspeitas de contaminação por vírus Zika:

Diagnóstico sorológico e RT-PCR em casos suspeitos em gestantes e recém-nascidos:

Recém-nascido vivo (RNV) com microcefalia possivelmente associada à infecção pelo vírus Zika, durante a gestação:

Instruções para coleta das amostras biológicas para diagnóstico em Natimorto suspeito de Microcefalia:
